Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf1cQ6PDZ2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms