Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrimpolQ6P1E7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms