Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slx4Q6P1D7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slx4Q6P1D7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms