Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms