Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms