Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Frem2Q6NVD0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms