Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh1Q6IUP1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh1Q6IUP1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh1Q6IUP1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh1Q6IUP1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh1Q6IUP1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh1Q6IUP1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh1Q6IUP1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh1Q6IUP1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh1Q6IUP1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh1Q6IUP1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh1Q6IUP1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh1Q6IUP1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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