Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg9bQ6EBV9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg9bQ6EBV9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms