Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sbno1Q689Z5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms