Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CilpQ66K08 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms