Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q66JV7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q66JV7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q66JV7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q66JV7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q66JV7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Q66JV7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q66JV7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q66JV7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q66JV7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q66JV7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q66JV7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q66JV7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q66JV7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q66JV7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q66JV7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q66JV7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q66JV7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q66JV7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q66JV7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q66JV7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms