Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8eQ66JT1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms