Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpaQ62189 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SnrpaQ62189 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms