Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtafrQ62035 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PtafrQ62035 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PtafrQ62035 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PtafrQ62035 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PtafrQ62035 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtafrQ62035 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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