Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Msi1Q61474 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms