Protein–RNA interactions for Protein: Q61234

Snta1, Alpha-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snta1Q61234 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snta1Q61234 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snta1Q61234 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms