Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JrkQ60976 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JrkQ60976 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JrkQ60976 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
JrkQ60976 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms