Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Laptm4aQ60961 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms