Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms