Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P4ha1Q60715 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P4ha1Q60715 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms