Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Samhd1Q60710 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samhd1Q60710 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms