Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SkiQ60698 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SkiQ60698 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms