Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxd4Q60688 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms