Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gprasp1Q5U4C1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gprasp1Q5U4C1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms