Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med13Q5SWW4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med13Q5SWW4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms