Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssh2Q5SW75 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh2Q5SW75 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms