Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LpoQ5SW46 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LpoQ5SW46 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms