Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psme4Q5SSW2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme4Q5SSW2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms