Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc85aQ5SP85 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms