Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scarf1Q5ND28 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms