Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim41Q5NCC3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms