Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms