Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prkaa1Q5EG47 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prkaa1Q5EG47 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms