Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otol1Q4ZJM7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otol1Q4ZJM7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms