Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pydc3Q3V3Q4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Pydc3Q3V3Q4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Pydc3Q3V3Q4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pydc3Q3V3Q4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms