Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ulk4Q3V129 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ulk4Q3V129 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ulk4Q3V129 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms