Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc27Q3V036 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc27Q3V036 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms