Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Kdm5aQ3UXZ9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdm5aQ3UXZ9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms