Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
E330034G19RikQ3UWX6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
E330034G19RikQ3UWX6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms