Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clca4bQ3UW98 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clca4bQ3UW98 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms