Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clpsl2Q3UW21 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms