Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slfn4Q3UV66 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slfn4Q3UV66 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms