Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6899Q3USS0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm6899Q3USS0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm6899Q3USS0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm6899Q3USS0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm6899Q3USS0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm6899Q3USS0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm6899Q3USS0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm6899Q3USS0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm6899Q3USS0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm6899Q3USS0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm6899Q3USS0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm6899Q3USS0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm6899Q3USS0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm6899Q3USS0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm6899Q3USS0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms