Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skap2Q3UND0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Skap2Q3UND0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms