Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cog7Q3UM29 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog7Q3UM29 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms