Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Usp19Q3UJD6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp19Q3UJD6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp19Q3UJD6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms