Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Trafd1Q3UDK1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trafd1Q3UDK1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms