Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kdm4dQ3U2K5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms