Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lmtk2Q3TYD6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lmtk2Q3TYD6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms