Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q3TTJ4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms